Theo đó, Ủy ban Kiểm tra Tỉnh ủy Phú Yên nhận thấy các thành viên Hội đồng bán đấu giá và các cán bộ chuyên môn đã vi phạm những điều đảng viên không được làm, trách nhiệm nêu gương của cán bộ, đảng viên; thiếu trách nhiệm, thực hiện không đầy đủ chức năng, nhiệm vụ được giao để xảy vi phạm pháp luật về đất đai, đấu giá, gây thất thoát, lãng phí ngân sách nhà nước.
Xét nội dung, tính chất, mức độ, nguyên nhân vi phạm; căn cứ Quy định của Bộ Chính trị về xử lý kỷ luật đảng viên vi phạm, Ủy ban Kiểm tra Tỉnh ủy Phú Yên quyết định thi hành kỷ luật: Cảnh cáo đối với các đồng chí: Trần Hoàng Thanh Quế, Đảng ủy viên, Phó Giám đốc Sở Tài chính; Nguyễn Lương Sinh, Thành ủy viên, Bí thư Chi bộ, Phó Chủ tịch Ủy ban MTTQ Việt Nam thành phố Tuy Hòa, nguyên Phó Chủ tịch UBND thành phố Tuy Hòa; Đỗ Trần Chương, đảng viên, Chi bộ khu phố Chu Văn An, thuộc Đảng bộ phường 5, thành phố Tuy Hòa (nguyên Phó Trưởng Ban Quản lý khu kinh tế Phú Yên); Nguyễn Trọng Cường, đảng viên, Chi bộ khu phố Trần Phú thuộc Đảng bộ phường 8, thành phố Tuy Hòa (nguyên Phó Giám đốc Sở Xây dựng); Nguyễn Trọng Hòa An, Phó Giám đốc phụ trách Trung tâm phát triển quỹ đất thuộc Sở Tài nguyên và Môi trường; Lê Hoàng Anh, đảng viên, chuyên viên Chi cục Thủy lợi thuộc Sở Nông nghiệp và Phát triển nông thôn, nguyên Phó Trưởng phòng Kinh tế, Văn phòng UBND tỉnh.
Thi hành kỷ luật bằng hình thức Khiển trách đối với các đồng chí: Nguyễn Quốc Khánh, đảng viên, Chi bộ Thanh tra tỉnh, nguyên Phó Chánh Thanh tra tỉnh; Công Văn Lãnh, Bí thư Đảng ủy, Phó Cục trưởng Cục Thuế tỉnh Phú Yên; Đặng Tấn Hòa, Ủy viên Ban Thường vụ Đảng ủy, Trưởng phòng Tổng hợp - Nghiệp vụ - Dự toán (nay là Phòng Nghiệp vụ - Dự toán - Pháp chế) Cục thuế tỉnh Phú Yên.
Liên quan đến vụ bán sỉ 262 lô đất khu đô thị Nam thành phố Tuy Hòa, Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an tỉnh Phú Yên đã tống đạt kết luận điều tra đến các bị can, chuyển hồ sơ vụ án sang Viện Kiểm sát nhân dân cùng cấp đề nghị truy tố 5 bị can do có vi phạm trong quá trình tổ chức bán đấu giá đất.
5 bị can bị đề nghị truy tố gồm: Nguyễn Chí Hiến, nguyên Phó Chủ tịch Thường trực Ủy ban nhân dân tỉnh Phú Yên nhiệm kỳ 2016 - 2021; Nguyễn Thị Nở, nguyên Phó Giám đốc phụ trách Sở Tài chính; Mai Hắc Lợi, Phó Giám đốc Sở Tư pháp; Ngô Quang Phú, Phó Giám đốc Sở Tài nguyên và Môi trường; Nguyễn Ngọc Duy, Phó Cục trưởng Cục Thuế. Các bị can trên bị đề nghị truy tố về tội “vi phạm quy định về quản lý sử dụng tài sản nhà nước gây thất thoát, lãng phí”.